De houten ramen, deuren en kozijnen van de Fortkerk zijn beeldbepalend voor het historische karakter van het gebouw. Tijdens de inspectie is vastgesteld dat deze onderdelen zich in matige staat bevinden. Op meerdere plaatsen is de verflaag sterk verweerd of afgebladderd, waardoor het hout kwetsbaar is voor weersinvloeden. Met name bij onderdorpels, stijlen en verbindingen is houtaantasting zichtbaar.
Daarnaast functioneren enkele luiken en deuren niet goed door houtvervorming en aangetaste scharnieren en sluitingen. Ook is bij vrijwel alle ramen sprake van inzakking.